目的:利用GEO数据库及网络药理学研究半枝莲、白花蛇舌草治疗乳腺癌肺转移和骨转移分子机制。方法:采用R语言差异分析GEO芯片获取疾病靶点；检索TCMSP、PubChem、SwissTargetPrediction数据库筛选药物有效成分的作用靶点；将药物靶点与疾病靶点取交集，通过STRING数据库构建PPI网络，并用Cytoscape进行可视化和拓扑分析，最后利用Web Gestalt数据库进行GO、KEGG富集分析。结果:经筛选后半枝莲主要包括28个有效成分，如黄芩素、木犀草素、槲皮素等，白花蛇舌草包括7个有效成分，如槲皮素、2,3-二甲氧基-6-甲基蒽醌等，半枝莲靶基因504个，白花蛇舌草靶基因313个。GEO数据库中分别筛选到364、4674个乳腺癌肺转移、骨转移差异基因。PPI网络各筛选出10个核心靶点。GO和KEGG富集分析表明，半枝莲、白花蛇舌草可通过影响转录调节复合物、转移酶复合物等细胞组分，调节β-catenin聚集等分子功能，干预Wnt、细胞周期、TGF-β等信号通路，参与调控细胞周期、T细胞活化等生物进程，治疗乳腺癌肺转移、骨转移则可能通过影响蛋白激酶复合物等细胞组分，调节类固醇结合、氧化还原酶活性等分子功能，干预细胞周期、P53、PI3K/Akt、FoxO等信号通路，参与类固醇代谢等进程。结论:初步揭示半枝莲、白花蛇舌草抗乳腺癌肺转移、骨转移的作用靶标和潜在机制，发现其作用是多成分、多靶点、多途径的，为今后分子生物学实验奠定基础。