亚太传统医药 ›› 2023, Vol. 19 ›› Issue (4): 141-149.DOI: 10.11954/ytctyy.202304034

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基于网络药理学和生物信息学分析金花茶花抗乳腺癌的药效物质基础及潜在机制

甘玲,杨扬   

  1. 桂林医学院药学院
  • 出版日期:2023-04-06 发布日期:2023-04-12
  • 基金资助:
    国家自然科学基金(32060090);广西自然科学基金2021JJA130119)

  • Online:2023-04-06 Published:2023-04-12

摘要: 目的:基于网络药理学和生物信息学手段,研究金花茶花抗乳腺癌的药效物质及可能机制。方法:通过检索文献和Swiss TargetPredition数据库收集金花茶花的活性成分和相应靶标,从DisGeNET、TTD、DrugBank、GEO和TCGA数据库获取乳腺癌相关靶标。使用ClusterProfiler包进行GO功能和KEGG通路富集分析。通过Cytoscape数据库构建PPI网络,经拓扑分析及预后价值分析筛选出核心成分和关键靶标。最后利用AutoDock Vina对核心成分和关键靶标进行分子对接。结果:通过匹配获得潜在靶标109个,对应36个活性成分,拓扑分析筛选出6个核心成分。GO分析和KEGG富集分析表明,金花茶花通过PI3K-Akt、MAPK、Ras和Rap1等信号通路富集发挥抗乳腺癌作用。生存分析获得11个关键靶标(ESR1、VEGFA、CASP3、SRC、ERBB2、MDM2、PI3KCA、PGR、PPARG、AR、MMP9)。分子对接结果表明,金花茶花核心成分与关键靶标蛋白具有良好的结合作用。结论:该研究初步揭示了金花茶花抗乳腺癌的药效物质、作用靶标和潜在机制,发现其作用是多成分、多靶点、多途径的,为今后的分子生物学实验奠定了基础。

关键词: 乳腺癌;金花茶花;网络药理学;生物信息学;分子对接