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表没食子儿茶素没食子酸酯对结肠炎作用的网络药理学分析及分子对接验证
袁文强，杨柳婵，陈晨，崔德
2023, 19 (12):
157-164.
[摘要]
( 9)
PDF
(4133KB)( 326)
可视化
目的:预测表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)缓解溃疡性结肠炎(UC)的可能的作用靶点及机制。方法:利用SwissTargetPrediction数据库和中药系统药理数据分析平台(TCMSP)检索EGCG相关靶基因。从GeneCards、DisGeNET、TTD和PharmGkb数据库中获得UC相关靶基因。将UC和EGCG相互作用的靶点进行差异分析、GO功能注释和KEGG通路富集分析。借助STRING数据库获取交集靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络，并通过Cytoscape 3.7.1软件进行可视化及拓扑学分析获得潜在关键靶点。筛选出的关键靶点通过PyMOL、AutoDock Vina等软件进行分子对接验证。结果:筛选出52个EGCG相关UC的靶基因。GO功能注释得到1 928个条目，如细胞增殖、氧化应激反应等。KEGG富集分析得到147个条目，如脂质与动脉硬化、PI3K-AKT Signaling Pathway、MAPK Signaling Pathway等通路。通过分子对接验证，发现EGCG与7个关键靶基因MAPK1、FOS、JUN、AKT1、TNF、HIF1A、RELA具有较强的结合能力。结论:EGCG通过调节多靶点、多信号通路作用UC。
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