亚太传统医药 ›› 2024, Vol. 20 ›› Issue (11): 170-177.DOI: 10.11954/ytctyy.202411033

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基于GEO芯片与网络药理学探讨半枝莲、白花蛇舌草治疗乳腺癌肺转移以及骨转移分子机制

周笛,周亮,刘丽芳   

  1. 湖南中医药大学第二附属医院健康管理中心,湖南中医药大学第一附属医院乳腺科
  • 出版日期:2024-11-05 发布日期:2024-11-19
  • 基金资助:
    湖南省教育厅科学研究项目(23A0272);“十四五”第一批中医药领导人才培养项目(湘中医药综合处便函[2022]5号);第七批全国老中医专家学术经验继承项目(国中医人教发[2022]76号)

  • Online:2024-11-05 Published:2024-11-19

摘要: 目的:利用GEO数据库及网络药理学研究半枝莲、白花蛇舌草治疗乳腺癌肺转移和骨转移分子机制。方法:采用R语言差异分析GEO芯片获取疾病靶点;检索TCMSP、PubChem、SwissTargetPrediction数据库筛选药物有效成分的作用靶点;将药物靶点与疾病靶点取交集,通过STRING数据库构建PPI网络,并用Cytoscape进行可视化和拓扑分析,最后利用Web Gestalt数据库进行GO、KEGG富集分析。结果:经筛选后半枝莲主要包括28个有效成分,如黄芩素、木犀草素、槲皮素等,白花蛇舌草包括7个有效成分,如槲皮素、2,3-二甲氧基-6-甲基蒽醌等,半枝莲靶基因504个,白花蛇舌草靶基因313个。GEO数据库中分别筛选到364、4674个乳腺癌肺转移、骨转移差异基因。PPI网络各筛选出10个核心靶点。GO和KEGG富集分析表明,半枝莲、白花蛇舌草可通过影响转录调节复合物、转移酶复合物等细胞组分,调节β-catenin聚集等分子功能,干预Wnt、细胞周期、TGF-β等信号通路,参与调控细胞周期、T细胞活化等生物进程,治疗乳腺癌肺转移、骨转移则可能通过影响蛋白激酶复合物等细胞组分,调节类固醇结合、氧化还原酶活性等分子功能,干预细胞周期、P53、PI3K/Akt、FoxO等信号通路,参与类固醇代谢等进程。结论:初步揭示半枝莲、白花蛇舌草抗乳腺癌肺转移、骨转移的作用靶标和潜在机制,发现其作用是多成分、多靶点、多途径的,为今后分子生物学实验奠定基础。

关键词: GEO;网络药理学;半枝莲;白花蛇舌草;乳腺癌肺转移及骨转移